📌 결론부터: 1가구2주택 종부세는 6월 1일 현재 몇 채인가로 정해졌고, 예외는 법에 적힌 범위만큼이었다
상속주택: 지분 상속주택이 세율 계산 때 주택 수에서 빠져도 그 당시 법으로는 1세대1주택 공제까지 받지 못했고(2023구합50455·2023누66759), 상속받은 집을 6월 1일 직후에 팔았어도 2주택이었습니다(2023구합56415). 반면 상속등기를 안 한 소수지분은 법정상속분으로 따져 주택 수에서 뺐습니다(조심2022서2477).
일시적 2주택: 2021년분은 특례 규정이 없어 과세됐고(조심2022서2383), 특례가 생긴 뒤에도 재건축으로 새로 지은 집은 구주택의 연장이라 일시적 2주택이 아니었습니다(조심2025소4289). 대법원은 대체취득 주체가 1주택 가진 본인이어야 한다고 봤습니다(2025두33779).
두 집을 하나로: 과세기준일에도 하나의 주택 구조였다는 자료가 있으면 1주택으로 경정됐지만(조심2024서3804), 호별로 따로 분양·등기·납세했거나 건물이 따로면 2주택이었습니다(조심2024서4704·2020구합73815).
🙋 이런 분께 맞는 판례입니다
☐ 집 한 채가 있는데 부모님 집을 상속받아 6월 1일에 2주택이 됐다
☐ 이사하려고 새집을 먼저 샀고 헌 집은 6월 1일 뒤에 팔았다
☐ 재건축이 끝난 집과 다른 집 한 채를 함께 가지고 있다
☐ 옆집이나 위아래 집을 터서 한 집처럼 쓰는데 2주택으로 고지됐다
두 개 이상 해당하면 아래 사건과 사실관계가 비슷합니다. 결론은 사건마다 다를 수 있습니다.
⭕ 납세자가 이겼어요 · ❌ 세무서가 이겼어요 · △ 일부만·다시 조사. 판례는 그 사건의 사실관계에 대한 판단입니다.
1가구2주택 종부세 다툼은 대부분 6월 1일 과세기준일 하루에 두 채가 겹친 데서 시작합니다. 상속을 받았거나, 이사하면서 새집을 먼저 샀거나, 두 집을 터서 한 집처럼 쓰는 경우입니다. 납세자는 사정상 잠깐 두 채였을 뿐이라고 하고, 세무서는 법에 적힌 예외가 아니면 2주택이라고 봤습니다.
이 글은 상속주택, 일시적 2주택, 재건축 주택, 두 집을 하나로 쓴 구조를 다룬 판결과 조세심판원 결정을 모았습니다. 종부세법은 해마다 바뀌어서 같은 상황도 몇 년분인지에 따라 결론이 달랐으므로, 사건마다 그 당시 법을 함께 적었습니다. 배우자·세대원 명의의 부속토지나 지방 저가주택 때문에 1세대1주택 공제가 빠진 사건은 8편, 미등기 상속주택의 납세의무자는 1편에 정리했습니다.
원고는 2016년 서울 반포 아파트를 보존등기했고, 2012년 상속받은 재개발 토지 지분으로 2019년 신촌 아파트 1/4 지분을 받았다가 2021. 4. 28. 일부를 증여해 2021. 6. 1. 현재 19/100 지분을 가졌습니다. 세무서는 처음에 조정대상지역 2주택 세율 3.6%를 적용했다가, 그 지분이 주택 수 제외 상속주택이라며 1.6% 세율로 감액경정했습니다.
원고는 상속 지분이 주택 수에서 빠지는 이상 1세대1주택자로 보아 5억 원 추가공제와 세액공제도 해야 한다고 주장했습니다. 법원은 그 당시 시행령 제4조의2 제3항이 상속주택을 제9조 제1항의 세율 적용 때 주택 수에서만 뺄 뿐, 1세대1주택자 정의 규정(시행령 제2조의3)에는 포함하지 않는다고 판단했습니다.
그래서 1세대1주택자에게만 주는 과세표준 공제와 세액공제까지 적용할 수는 없다며 청구를 기각했고(2021년분, 그 당시 법), 서울고등법원 2023누66759도 항소를 기각했습니다.
판결문: 「제9조 제6항, 제7항에 따라 ‘1세대 1주택자’에게만 부여되는 과세표준 금액의 공제나 세액 공제에 관한 규정까지 적용된다고 볼 수 없다.」
원고는 2021. 6. 1. 당시 서초구 아파트 1/2 지분을 가지고 있었고, 어머니가 2021. 3. 29. 사망하자 2021. 4. 26. 관악구 아파트를 협의분할 상속으로 등기했습니다. 그 뒤 2021. 6. 14. 그 집을 파는 계약을 맺고 10. 29. 이전등기를 해 주었습니다.
세무서는 과세기준일 6월 1일 기준으로 두 주택을 모두 과세대상에 넣어 2021년 귀속 종부세 7,300,650원을 고지했습니다. 원고는 상속으로 일시적·우발적으로 2주택이 된 사람에게 예외를 두지 않은 법령이 재산권과 평등권을 침해한다고 주장했습니다.
법원은 상속받은 집을 팔지 보유할지는 스스로 선택할 수 있고 과세기준일 뒤 처분은 사후 사정에 불과하며, 지분율·공시가격 상한으로 예외를 둔 방식이 현저히 비합리적이지 않다며 청구를 기각했습니다.
② 상속등기를 안 한 소수지분
⚖️ 조세심판원 조심2022서2477 (2022. 9. 14. · 조세심판원 결정) — ⭕ 미등기 상속주택도 법정상속분 20%·3억 이하면 주택 수 제외
청구인의 아버지는 2007. 3. 25. 사망했고 상속인들은 2021. 6. 1.까지 상속등기도, 사실상 소유자 신고도 하지 않았습니다. 지자체는 연장자인 청구인을 주된 상속자로 보아 재산세를 부과했고, 처분청은 청구인이 방배동 주택과 상속주택을 가진 조정대상지역 2주택자라며 중과세율 3.6%로 2021년 귀속 종부세를 고지했습니다.
처분청은 상속인들의 지분(각 20%)이 2021. 12. 6. 등기로 확정됐으니 과세기준일 뒤 사정이라고 했지만, 조세심판원은 민법상 상속에는 등기가 필요 없으므로 법정상속분으로 지분율을 따져야 하고, 지분 소유 상속주택 제외 규정이 상속등기된 경우로 한정되지 않는다고 판단했습니다.
청구인의 법정상속분이 20% 이하이고 지분 공시가격도 그 당시 기준(3억 원) 이하라며 상속주택을 주택 수에서 빼고 세액을 경정하라고 결정했습니다.
청구인은 2000. 12. 2. 취득한 종전주택을 가진 상태에서 2021. 5. 31. 대체주택을 취득했고, 종전주택은 2021. 11. 8. 양도했습니다. 처분청은 2021. 6. 1. 현재 두 주택 공시가격을 합산해 2021년 귀속 종부세를 고지했습니다.
청구인은 실거주 목적의 매매 시차 때문에 잠깐 2주택이 된 것이라고 주장했습니다. 조세심판원은 보유 목적이 실거주였더라도 그 당시 종부세법에는 일시적 1세대 2주택자를 과세에서 빼는 규정이 없다며 기각했습니다.
판결문: 「설령 그 보유목적이 투기가 아니라 실거주에 있었다 하더라도 종합부동산세 관련 법령 상 일시적 1세대 2주택 보유자에 대한 과세를 제외한다는 별도의 규정을 두고 있지 아니한 점」
⚖️ 조세심판원 조심2025소4289 (2026. 6. 1. · 조세심판원 결정) — ❌
청구인은 2024. 6. 1. 현재 대전 주택(2017. 8. 4. 매수)과 서울 재건축주택을 가졌습니다. 재건축주택은 2004. 12. 6. 취득한 구주택이 2020. 1. 3. 멸실된 뒤 2024. 5. 27. 준공된 것이었습니다.
청구인은 재건축주택을 준공일에 새로 취득했고 대전 주택을 3년 안인 2025. 3. 27. 팔았으니 일시적 2주택이라며 환급을 경정청구했습니다. 처분청은 재건축주택의 취득일은 구주택 취득일이라며 거부했습니다.
조세심판원은 구주택을 헐고 재건축했어도 별개의 주택으로 보기 어렵고, 준공일을 기준으로 하면 철거·신축 시기에 따라 종전주택 처분 유예기간이 얼마든지 늘어나 일시적 2주택 특례 취지와 형평에 맞지 않는다며 기각했습니다.
판결문: 「구주택을 철거하고 그 부지에 재건축주택을 신축하였다 하더라도 이를 구주택과 별개의 주택으로 보기는 어려움」
④ 대법원이 본 일시적 2주택 조항의 주체
⚖️ 대법원 2025두33779 (2025. 9. 11.) — ❌ 일시적 2주택·지방 저가주택 특례 주체는 1주택 가진 본인
2022. 6. 1. 원고는 강남 아파트를, 같은 세대 배우자는 속초 아파트(지방 저가주택)를 가졌던 사건입니다. 쟁점은 지방 저가주택 특례였지만, 대법원은 그 해석을 위해 같은 항의 일시적 2주택 조항(제8조 제4항 제2호)부터 봤습니다.
대법원은 제2호가 1주택을 양도하고 다른 주택을 대체취득하는 주체를 1세대1주택자로 법문에 적어 두었으므로, 1주택 소유자 본인이 아닌 다른 세대원이 다른 주택을 사들인 경우는 일시적 2주택에 해당하지 않는다고 봤습니다.
이 해석은 같은 항 나머지 각 호에도 통일적으로 유지돼야 한다며, 배우자 명의 지방 저가주택도 특례 대상이 아니라고 보고 상고를 기각했습니다. 지방 저가주택 쟁점은 8편에서 자세히 다룹니다.
판결문: 「해당 1주택 소유자 외의 다른 세대원이 다른 주택을 대체취득한 경우는 여기에 해당하지 아니한다는 결론이 도출된다.」
⑤ 두 집을 하나로 쓴 구조
⚖️ 조세심판원 조심2024서3804 (2024. 12. 30. · 조세심판원 결정) — ⭕ 과세기준일에도 두 주택이 하나로 쓰인 구조였다고 보아 1주택으로 종부세 경정
청구인은 2021년 과세기준일 현재 남양주 주택, 용산구 주택 2채, 부산 주택을, 2022년 과세기준일 현재 용산구 주택 2채를 가지고 있었고, 처분청은 용산구 두 주택을 별개의 주택으로 보고 경정청구를 거부했습니다.
조세심판원은 청구인이 낸 현장사진과 용산구청장이 현장조사를 한 시점의 외부 구조에 비추어, 과세기준일부터 현장조사 시점 사이에 두 주택이 별개 주택에서 하나의 주택으로 바뀌었다고 볼 특별한 사정이 보이지 않는다고 판단했습니다.
그래서 2021년과 2022년 과세기준일 현재 용산구 두 주택을 하나의 주택으로 보아 종부세 과세표준과 세액을 경정하라고 결정했습니다.
⚖️ 조세심판원 조심2024서4704 (2024. 12. 23. · 조세심판원 결정) — ❌ 호별 별도 등기·분양·납세한 두 호는 붙여 써도 1주택으로 못 봄
청구인들은 2003. 2. 13. 강남구 아파트 두 개 호를 시행사로부터 처음 분양받아 계속 거주했고, 처분청은 각 호별로 2021~2022년 귀속 종부세를 고지했습니다. 청구인들은 두 호를 하나의 주택으로 쓰고 있으니 1세대1주택으로 보아 달라고 경정청구했으나 거부됐습니다.
조세심판원은 두 호가 공부상 각 호별로 따로 등록·관리돼 독립적으로 소유·양도할 수 없다고 단정하기 어렵고, 청구인들이 각 호를 단독으로 분양받아 각자 지분 100%를 유지하며 취득세·재산세도 호별로 냈다는 점을 들었습니다.
이를 공동명의 1세대1주택으로 보기 어렵다며 심판청구를 기각했습니다.
💬 배우자 명의 부속토지·지방 저가주택 때문에 1주택 공제가 빠진 사건은 따로 정리했습니다
판결문·결정문 이유에서 실제로 받아들이거나 물리친 지점만 옮겼습니다. 비슷해 보여도 사실관계와 그해 법령이 다르면 결론이 달라질 수 있습니다.
🔀 납세자와 세무서의 공방, 무엇이 통했나
🔀 상속으로 2주택이 된 경우
⚔️ 납세자 — 이렇게 주장했다
상속 지분이 주택 수에서 빠지는 이상 1세대1주택자로 보아 공제와 세액공제를 해야 한다고 주장했으나 받아들여지지 않았습니다(2023구합50455).
상속으로 우발적으로 2주택이 됐고 곧 팔았는데 예외를 두지 않은 법령은 위헌이라고 주장했으나 받아들여지지 않았습니다(2023구합56415).
상속등기는 과세기준일 뒤에 했지만 법정상속분이 20% 이하이므로 주택 수에서 빼야 한다는 주장은 받아들여졌습니다(조심2022서2477).
🛡️ 세무서 — 통한 방어
주택 수 제외 규정은 세율 적용 범위로 한정되고 1세대1주택자 정의에는 들어 있지 않다는 주장이 받아들여졌습니다(2023구합50455).
상속받은 주택을 처분할지는 스스로 선택할 수 있으므로 과세기준일 뒤 처분은 사후 사정이라는 주장이 받아들여졌습니다(2023구합56415·2022구합59226).
⛔ 막힌 주장 — 법원이 받아들이지 않은 것
상속인 지분은 등기로 확정됐으니 과세기준일 뒤 사정이라 영향이 없다는 처분청 주장(조심2022서2477)
🔀 이사·재건축으로 잠깐 2주택이 된 경우
⚔️ 납세자 — 이렇게 주장했다
실거주 목적의 매매 시차로 잠깐 2주택이 된 것이라고 주장했으나, 2021년분에는 일시적 2주택 과세 제외 규정이 없었습니다(조심2022서2383).
재건축주택은 준공일에 새로 취득한 것이고 3년 안에 다른 집을 팔았으니 일시적 2주택이라고 주장했으나 기각됐습니다(조심2025소4289).
🛡️ 세무서 — 통한 방어
재건축은 구주택이 신축 주택으로 바뀐 것에 불과하고, 장기보유 세액공제도 멸실된 주택 취득일부터 계산하므로 일시적 2주택에서도 같은 날로 봐야 한다는 주장이 받아들여졌습니다(조심2025소4289).
일시적 2주택 조항은 대체취득 주체를 1세대1주택자로 정했다는 해석이 대법원에서 받아들여졌습니다(2025두33779).
⛔ 막힌 주장 — 법원이 받아들이지 않은 것
2022년 개정된 일시적 2주택 특례를 2021년분에도 적용해 달라는 주장, 소급할 수 없다고 봤습니다(조심2022서7007)
판결문·결정문에 나온 주장과 판단만 정리했습니다. ‘이렇게 하면 환급된다’는 뜻이 아니라 ‘이 사건에서 이렇게 봤다’는 기록입니다.
🔺 사고팔 때, 중개사·세무 실무에서 볼 것
🧰 잔금일과 6월 1일 — 새집을 먼저 사고 헌 집을 나중에 파는 경우, 6월 1일에 두 채가 겹치는지가 결론을 갈랐습니다(조심2022서2383). 지금은 일시적 2주택 특례가 있지만 신규주택 취득일부터 기한(조정대상지역끼리 2년, 그 밖 3년) 안에 팔아야 하므로 잔금 일정을 같이 짜야 합니다.
🧰 재건축 아파트 매매 — 재건축이 끝난 집을 가진 사람이 다른 집을 살 때 준공일을 새 취득일로 보아 일시적 2주택을 기대하는 경우가 있지만, 조세심판원은 구주택의 연장으로 봤습니다(조심2025소4289). 이 점을 계약 전에 확인하도록 안내하세요.
🧰 상속 매물 — 상속받은 집을 팔더라도 6월 1일 뒤에 넘기면 그해에는 주택 수에 들어갔습니다(2023구합56415). 상속주택 매도 일정을 잡을 때 과세기준일을 함께 보세요.
⚖️ 걸리는 조문: 종합부동산세법 제8조 제4항(1세대 1주택자로 보는 경우), 시행령 제4조의2(1세대 1주택자의 범위)
6월 1일 과세기준일 전후 잔금·등기, 임대등록 상태, 주택 수는 계약 단계에서 확인할 수 있습니다.
🧭 다투는 길, 어디에 무엇을 청구했나
입장
누구에게
무엇을
판례에서는
🙋 납세자
세무서(이의신청) → 조세심판원 → 행정법원 → 고등법원
상속 지분 주택 1세대1주택 공제 적용
그 당시 법으로 기각(2023구합50455·2023누66759)
🙋 납세자
조세심판원
미등기 상속 지분 주택 수 제외
법정상속분 20%·3억 이하로 인용(조심2022서2477)
🙋 납세자
세무서(경정청구) → 조세심판원
일시적 2주택 1세대1주택 환급
재건축 주택은 기각(조심2025소4289), 2021년분은 규정 없어 기각(조심2022서2383)
지금 시행령 제4조의2 제1항의 일시적 2주택 특례는 신규주택 취득일부터 조정대상지역에서 조정대상지역으로 옮긴 경우 2년, 그 밖은 3년 안이어야 합니다(2026. 9. 30. 개정). 조심2025소4289의 2024년분은 그 당시 3년 기준이었습니다.
상속주택은 상속개시일부터 5년 안, 지분 40% 이하, 지분 공시가격 6억 원(수도권 밖 3억 원) 이하이면 주택 수에서 빠집니다(시행령 제4조의2 제2항·제4조의3 제3항). 2021년분 사건(조심2022서2477)의 20%·3억 원 기준보다 넓어졌습니다.
2025년분을 다룬 조심2026소1528에 인용된 지금 법 제8조 제4항 제3호는 1주택과 위 요건의 상속주택을 함께 가진 경우도 1세대1주택자로 봅니다. 2021년분에 공제를 인정하지 않은 2023구합50455와 달라진 부분이지만, 함께 가진 사람이 같은 세대원 1명이어야 한다는 점은 그대로였습니다.
1가구2주택 종부세, 내 상황에서 먼저 확인할 것
6월 1일 현재 세대원 각자 명의로 몇 채(지분 포함)를 가졌는지
상속주택이 상속개시일부터 5년 안인지, 지분 40% 이하·공시가격 요건에 맞는지
갈아타기라면 신규주택 취득일과 처분 기한(2년 또는 3년)이 언제인지
재건축 주택이라면 구주택 취득일이 언제인지
두 집을 하나로 쓴다면 그 구조가 6월 1일에도 그랬다는 사진·조사 자료가 있는지
💬 1세대1주택으로 계산됐는지는 고지서의 공제금액과 세율로 확인할 수 있고, 이미 낸 세금은 경정청구로 다툴 수 있습니다. 홈택스에서 고지 내역부터 확인해 보세요
서울행정법원 2023구합50455는 2021년분 사건에서 요건을 갖춘 지분 상속주택은 세율 적용 때 주택 수에서만 빠질 뿐 1세대1주택자 정의 규정에는 포함되지 않으므로, 1세대1주택자에게만 주는 과세표준 공제와 세액공제까지 적용할 수는 없다고 판단했고 서울고등법원 2023누66759도 항소를 기각했습니다. 다만 2025년분 사건인 조세심판원 조심2026소1528에 인용된 지금 법은 1주택과 요건을 갖춘 상속주택을 함께 가진 경우를 1세대1주택자로 보는 조항을 두고 있어, 몇 년분인지에 따라 결론이 다를 수 있습니다.
Q. 새집을 먼저 사고 헌 집은 6월 1일 뒤에 팔았어요.
조세심판원 조심2022서2383은 2021. 5. 31. 대체주택을 사고 11월에 종전주택을 판 사건에서, 그 당시 종부세법에는 일시적 1세대 2주택자를 과세에서 빼는 규정이 없다며 기각했습니다. 그 뒤 일시적 2주택 특례가 생겼지만, 조세심판원 조심2025소4289는 재건축으로 준공된 집은 구주택의 연장이라 신규 취득으로 볼 수 없다고 했고, 대법원 2025두33779는 대체취득 주체가 1주택 가진 본인이어야 한다고 봤습니다.
Q. 옆집을 사서 터서 쓰는데 1주택으로 볼 수 있나요?
조세심판원 조심2024서3804는 현장사진과 구청 현장조사 결과로 볼 때 과세기준일에도 두 주택이 하나로 쓰인 구조였다고 보아 하나의 주택으로 경정하라고 결정했습니다. 반면 조심2024서4704는 각 호를 따로 분양받아 각자 지분 100%로 호별 취득세·재산세를 낸 경우 하나로 써도 1세대1주택으로 보지 않았고, 서울행정법원 2020구합73815도 한 필지 위 다가구 2동을 별개 주택으로 봤습니다.
✍️ 글쓴이 지중해부자 — 2008년 공인중개사 자격 취득 후 몇 년간 중개 현장 경험, 이후 지금까지 경매·부동산 세금 실무와 상속·민사 사건을 겪어 왔습니다. 이 연재는 종합부동산세 판결문과 조세심판원 결정문 원문을 직접 읽고 “비슷한 다툼에서 법원과 조세심판원이 무엇을 보고 판단했는지”를 정리한 것입니다.
※ 이 글은 2026년 11월 9일 기준 법령·판결문·조세심판원 결정문 원문을 읽고 정리한 일반 정보이며, 세무·법률 자문이 아닙니다. 판결과 결정은 그 사건의 사실관계와 그 당시 법령에 따른 결론이라 내 사건에 그대로 적용되지 않을 수 있고, 종부세법은 해마다 바뀝니다. 구체적인 사건은 세무사·변호사와 상담하거나 국세청 126 상담센터를 이용하세요. 개별 사건 상담은 댓글로 답하지 않습니다.
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